據臺灣《聯合報》報道，臺灣檢方特偵組說，《美麗島電子報》2014年10月15日首度披露馬英九團隊收受頂新政治獻金一事，相關文章所指，收受政治獻金者并未指馬英九，而以馬英九團隊泛稱。媒體雖連日報道討論此事，直至2014年12月23日，經周玉蔻在廣播節目中指述馬英九團隊指的就是馬英九，特偵組才依法于2014年12月24日分查字案調查。

　　陳水扁案部分，媒體2015年3月9日報道，民進黨前發言人徐佳青于農歷年間赴美演講中，指涉陳水扁收受建筑商幾十億元(新臺幣)一事，由于報道指述陳水扁涉有違法收受政治獻事實，已屬特偵組職司案件范圍，為查明徐所指述事實是否已在以前陳水扁案中調查完畢，或有其他新事實，故于2015年3月10日分查字案調查。

　　這兩案分案時間，都在媒體明確披露對象后即刻于翌日依規定分查字案調查，沒有偏袒誰。